Benjamin Pavard từng được cho xảy ra xích mích với BLĐ Bayern Munich. Trong chiến thắng 6-2 của Bayern trước Mainz, Pavard chỉ được vào sân từ ghế dự bị. Anh là cầu thủ đầu tiên rời phòng thay đồ sau khi trận đấu kết thúc.
Chính vì vấn đề mâu thuẫn với đội bóng, anh được cho nhiều khả năng chia tay sân Allianz Arena. Dù vậy, mọi chuyện giữa Pavard và Bayern có vẻ ổn thỏa vào thời điểm hiện tại. Theo đó, cựu cầu thủ Stuttgart đưa ra những phát biểu về việc muốn gắn bó tiếp tục với CLB chủ quản:
Pavard muốn ở lại Bayern thay vì ra đi.
"Tôi không phải là mẫu cầu thủ kết thúc cuộc hành trình của mình giữa chừng. Mục tiêu của tôi chắc chắn là ở lại Bayern. Tôi quyết tâm cống hiến tất cả cho CLB và tôi muốn giành càng nhiều danh hiệu càng tốt với Bayern."
"Tôi luôn nhận được sự ủng hộ của câu lạc bộ. Tôi đã cảm thấy ổn trong một thời gian dài. Về vấn đề bằng lái xe, tôi đã phạm sai lầm và tôi đã thừa nhận điều đó. Không ai là hoàn hảo cả, tôi rút kinh nghiệm từ đó."
