Không nằm ngoài dự đoán, trên sân Pleiku các cầu thủ Becamex Bình Dương đánh bại HAGL với tỉ số 3-1. Kết quả chung cuộc sau hai lượt trận đi và về của tứ kết Cup QG 2016 với tổng tỉ số 8-4.
Dù có được kết quả có lợi với tỉ số 1-1 ở trận đấu lượt đi trên sân Cẩm Phả của Than Quảng Ninh. Rất tự tin và có được lợi thế khi có được hai bàn thắng vươn lên dẫn trước trong 90 phút trên sân nhà. Thế nhưng, ở những phút bù giờ cuối cùng Long An đã bất ngờ để đội khách Than Quảng Ninh có được hai bàn gỡ để qua đó cân bằng tỉ số 3-3. Dù hòa nhau 3-3 ở hai lượt trận nhưng do tính bàn thắng sân khách sân nhà Long An chấp nhận chia tay Cup QG 2016.
Dù không có nhiều tham vọng ở Cup QG năm nay, thế nhưng thật sự bất ngờ khi QNK Quảng Nam có được chiến thắng 3-0 trước Hải Phòng. Trên sân Lạch Tray ở trận lượt đi, Hải Phòng để các học trò HLV Hoàng Văn Phúc cầm hòa 1-1. Với tổng tỉ số 4-1 sau hai lượt trận, QNK Quảng Nam là đội bóng gây nhiều ấn tượng khi có mặt ở bán kết.
Đôi chút bất ngờ đã xảy ra ở trận đấu lượt đi trên sân Thiên Trường – Nam Định. Thế nhưng, khi làm khách trên sân Hàng Đẫy, đội bóng “tí hon” Nam Định đã chấp nhận thất bại 3-1. Với chiến thắng thuyết phục trước đội bóng hạng nhất, thầy trò HLV Chu Đình Nghiêm còn nguyên tham vọng lần thứ hai liên tiếp góp mặt ở trận chung kết Cup QG 2016.